AMASYA MÜZESİ: Kalkolitik Çağ'dan itibaren Tunç Çağı, Hitit, Urartu, Frig, İskit, Pers, Hellenistik, Roma, Bizans, Selçuklu ve Osmanlı dönemlerine ait 12 aynı medeniyete ait Arkeolojik, Etnoğrafik, Sikke, mühür, El Yazması ve Mumyalar olmak üzere bugün itibari ile 23.476 eseri ile Hazeranlar Konağı ve Kral Kaya Mezarları Örenyeri ile birlikte üç birim halinde bölgenin en modern müzesi olarak ülkemiz kültür ve turizmine hizmet etmektedir.

DARÜŞŞİFA (BİMARHANE) SABUNCUOĞLU TIP VE CERRAHİ MÜZESİ:  Sabuncuoğlu, Amasya'daki Bimarhane'de Burhaneddin Ahmed’den tıp eğitimi aldıktan sonra yine burada 17 yaşında hekimlik yapmaya başlamıştır. Sabuncuoğlu Şerafeddin 14 yıl boyunca da Bimarhane'de çalışmalarını sürdürmüştür. Yaptığı çalışmalar sonucunda zamanla adı bütün Anadolu'da duyurmuş bir tıp alimidir. Müze tıp alanında hizmet vermiş Sabuncuoğlu Şerafeddinin kullandığı araçlar ve teknikleri sergilemektedir.

ŞEHZADELER MÜZESİ:Müzemizde Amasya'da valilik yapan fakat sultan olamayan şehzadelerin balmumu heykelleri ve Amasya'da valilik yapıp, sonra Osmanlı Devleti'nde sultan olan(Şehzade) padişahların balmumu heykelleri sergilenmektedir. Müzenin tasarımında yaklaşık 150 yıllık bir zaman diliminin etkin sanat unsurlarına yer verilmiştir. Müzeye hâkim olan kalem işi desenler, çini panolar, tavan göbekleri, hat, tezhip, minyatür ve ebrular 14., 15. ve 16. yüzyıl sanat anlayışını yansıtmaktadır.

FERHAT & ŞİRİN AŞK MÜZESİ: Yüzyıllar boyunca aşkın tarifi yaşanan efsanelerin üzerine yapılmıştır. Ferhat & Şirin, Kerem & Aslı, Leyla & Mecnun, Romeo & Juliet gibi aşıkların yanı sıra Mevlana, Yunus Emre gibi İlahi aşklarında sergilendiği çok özel bir müzedir.

MİNYATÜR AMASYA MÜZESİ: Minyatür Amasya Müzesi, 1914 yılında çekilmiş bir fotoğraftan esinlenerek yapılan bir tarihi kent maketidir. Sultan Beyazıt Külliyesinin imaret binasının bir salonu içinde 80 m² lik bir alanda yer alır.